Cụ thể, Ủy ban Thường vụ Quốc hội nhất trí điều chuyển 735 tỷ đồng dự toán kinh phí đảm bảo hoạt động năm 2018 của Tổng cục Thuế, để bổ sung dự toán kinh phí hoạt động năm 2018 cho Tổng cục Hải quan; trong đó, bố trí 223 tỷ đồng chi đầu tư xây dựng cơ bản và 512 tỷ đồng chi cho mua sắm trang thiết bị.

Nguồn kinh phí trên được sử dụng cho các dự án xây dựng cơ bản, mua sắm, hiện đại hóa trang thiết bị và đầu tư ứng dụng công nghệ thông tin theo Đề án đã được cấp có thẩm quyền phê duyệt cho Tổng cục Hải quan và phải đảm bảo các quy định của Luật Ngân sách nhà nước, Luật Đầu tư công.

Ủy ban Thường vụ Quốc hội yêu cầu Chính phủ chỉ đạo Bộ Tài chính và các cơ quan liên quan đảm bảo các nguồn kinh phí còn lại (sau khi đã điều chuyển giữa hai Tổng cục) được thực hiện đúng theo quy định của pháp luật.

Tổ chức đánh giá, rà soát và đề xuất sửa đổi các tỷ lệ khoán kinh phí đảm bảo hoạt động cho Tổng cục Thuế và Tổng cục Hải quan giai đoạn 2016 - 2020 quy định tại Nghị quyết 1094/NQ-UBTVQH13 ngày 8/12/2015 của Ủy ban Thường vụ Quốc hội cho phù hợp với việc tinh giản và sắp xếp lại bộ máy, thực hành tiết kiệm, chống lãng phí để trình Ủy ban Thường vụ Quốc hội quyết định và áp dụng cho các năm 2019, 2020.

Tổ chức thu vào ngân sách nhà nước toàn bộ dự toán kinh phí đảm bảo hoạt động của Tổng cục Thuế, Tổng cục Hải quan còn dư sau thời gian chỉnh lý quyết toán ngân sách nhà nước niên độ 2020 (sau ngày 31/1/2021).